农作物新品种的价值评估是根据特定的评估目的，由专门机构和人员依据相关的法律、法规、规章及制度要求，在充分考虑农作物新品种价值评估特点的基础上，对所要评估的品种进行全面系统的评定，以确定其价值。农作物新品种价值评估具有以下特殊性：

1、评估对象的确定较为复杂

农作物新品种是无形资产，作为其载体的种子也不宜识别，因此，其价值评估必须有专业人士的参与或提供咨询意见才能完成。农作物新品种有可能在未经审定前就进行转让，因此必须要核实有关的资料和法律文书等。

2、评估价值影响因素的特殊性

在进行农作物新品种价值评估时，除了考虑技术性因素、市场因素、经济因素外，还要考虑自然环境因素，自然环境对农作物品种的价值影响是巨大的。由于作为农作物品种承载体的是具有生命力的农作物，其具备显著的地域性特点。当自然环境适宜农作物生长时，农作物的品种效用能得到较大的发挥；反之，当自然环境不适宜该农作物品种生长时，农作物新品种的效用就不能得到充分的体现。

并且，一种品种抵御自然风险的能力强，即在遭受自然灾害的情况下，所评估品种的载体对自然灾害的抵御能力或自我适应和自我恢复能力强，那么该品种相对于其他弱势品种就应该具有较高的评估价值。例如，近几年研发的抗虫棉、抗倒伏玉米和抗倒伏小麦等品种。

另外，一种新品种的价值，在自然灾害发生频率不同的地区也将具备不同的评估价值。如某一品种在某地区具有很高的经济价值，而在另一个地区，由于不适应该地区频发的自然灾害或其自然条件，它的经济价值就很低。因此，相同的品种在不同的地域就可能具有不同的评估价值。在某种前提下，这种差异还可能非常显著。